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Verfasst am 16.01.2009 01:02:00 Uhr
Die Carbonate lächeln mir im SMILES-Code entgegen
Der Endlos-"Roman"! Ergänzungen sind höchstwahrscheinlich! Dieser Beitrag ergänzt meinen früheren vom 3.1.2006. Im Folgenden soll für meine Zwecke tabellarisch etwas Übersichtlichkeit in die riesige vid-nummerngesteuerten Datensammlung von emolecules.com gebracht werden. Allein fast 800 Datenbank-Einträge wurden zum Stichwort "carbonate" gefunden. Die wissenschaftliche Existenz diverser Molekülformen wird hier ungeprüft vorausgesetzt und kann von jedem Leser im Zweifelsfall selbst verifiziert werden. Um nicht nach einem Jahr hunderte von "zerbrochenen Links" zu haben, werden die vid-Quellen wegen der Lebensdynamik von Webseiten hier nicht verlinkt. Zum Beispiel gehört die vid-Nummer 476327 zum Link (plus Leerzeichen zwecks Zeilenumbruch) http:// www.emolecules.com/ cgi-bin/ more? vid=476327. Da es sich hier um keine WarenbestellListe handelt, sind die vid-Nummern lediglich als Quellenangabe zu verstehen (Stand: 15.1.2009, da gleiche Inhalte für vid-Nummern nicht garantiert werden). Die Nomenklatur ist hier wegen Vereinfachung meistens auf Englisch wiedergegeben. (z.B.: "potassium" (engl.) = "Kalium"(dts.); "sodium" (engl.) = "Natrium" (dts.); "oxide" (engl.) = "oxid" (dts.)) Auf diverse Angaben wie "calculated LogP", "logP Error", "PSA(A2)", "FRB" kann aus Zeitmangel nur später eingegangen werden. Es bezeichnen "H Bond Donors" (HBD) die Anzahl möglicher Wasserstoffbrücken-Bildner (z.B. alkoholische H-Atome), "H Bond Acceptors" (HBA) die Anzahl möglicher Wasserstoffbrücken-Empfänger.
| vid | HBD | HBA | logP | SMILES | Molekülbezeichnung (engl.) |
|---|---|---|---|---|---|
| 474232 | 0 | 2 | 0,83 | O=C=O | CARBON DIOXIDE CARBONDIOXIDE CO2 KOHLENDIOXID dioxomethane ANM.: STANDARD SOLUTION 1ML=0.1MGCO2 |
| 883802 | 0 | 2 | O=C=O.O=[Zr]=O.O=[Zr]=O | Zirconium carbonate, basic hydrate Zirconium oxycarbonate | |
| 6877006 | 0 | 2 | O=C=O.O=[Zr]=O.O=[Zr]=O.O=[Zr]=O | IRCONIUM (IV) CARBONATE BASIC HYDRATE | |
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